Задача автоматического восстановления иерархической структуры регуляторной области эукариотического гена поставлена на стыке биологии, математики и информационных технологий. Решение этой задачи предполагает понимание сложных механизмов регуляции генов эукариот и применение интеллектуальных технологий для многопараметрического анализа. В данной работе приведено описание интегрированной системы, которая реализует метод реляционного анализа биологических данных. Система позволяет учитывать доступную биологу априорную информацию об анализируемых данных, осуществлять анализ на каждом уровне организации регуляторного района, последовательно производить поиск решения от простой гипотезы к более сложной. Интеграция систем предоставляет удобную среду для проведения комплексных исследований и автоматизации работы эксперта-биолога.
The task of automatic extraction of hierarchical structure of eukaryotic gene regulatory region is posed on the junction of the fields of biology, mathematics and information technologies. A solution of the problem implies understanding of the sophisticated mechanisms of eukaryotic gene regulation and applying data mining technologies for analysis with many features. The paper discusses the integrated system implementing a powerful relation mining of biological data. The system allows taking into account prior information about the analyzed data that is known by the biologist, performing the analysis on each hierarchical level, searching for a solution from a simple hypothesis to a complex one. The integration of the system provides a convenient environment for conducting complex research and automating the work of the biologist.
