Adenosine receptor A 2B is a weakly studied target for bronchial asthma, chronic obstructive pulmonary disease therapy. For a structure-based design project, the three-dimensional information of the designated target is needed. Unfortunately, experimental structure data for A 2B adenosine receptor and is not yet available. Homology building (program Modeller) was used to generate three-dimensional structure data using structure information of a homologous protein – A 2A adenosine receptor. Then, three-dimensional structures of adenosine receptor ligands (9 activators and 15 inhibitors) were created using program ChemSketch. Activators and inhibitors were then docked into the active site of A 2B adenosine receptor using the program AutoDock 4.0. Our results show several amino acids plays the most critical role in the binding of most activators and inhibitors.
Аденозиновый рецептор типа A 2B экспрессируется многими иммунными клетками и опосредует развитие и поддержание хронического воспаления при бронхиальной астме. В связи с этим аденозиновый рецептор типа A 2B рассматривается как мишень в терапии больных с некоторыми заболеваниями легких. Для анализа особенностей взаимодействия молекулы данного рецептора с молекулами различных активаторов и ингибиторов применялось компьютерное моделирование. Созданы модели аденозинового рецептора типа A 2B и двух его мутантных форм (программа Modeller), а также 9 активаторов и 15 ингибиторов данного рецептора (программа ChemSketch). На основании полученных моделей произведен расчет лиганд-рецепторных взаимодействий с использованием программы AutoDock 4.0. Установлена предрасположенность взаимодействия активаторов и ингибиторов с определенными аминокислотами лиганд-связывающего центра аденозинового рецептора типа A 2B .
